Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRXP46100 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATRXP46100 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATRXP46100 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRXP46100 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRXP46100 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRXP46100 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRXP46100 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRXP46100 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRXP46100 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATRXP46100 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRXP46100 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRXP46100 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRXP46100 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRXP46100 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRXP46100 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRXP46100 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRXP46100 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRXP46100 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRXP46100 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRXP46100 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRXP46100 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRXP46100 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRXP46100 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRXP46100 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRXP46100 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRXP46100 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRXP46100 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRXP46100 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRXP46100 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRXP46100 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRXP46100 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRXP46100 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRXP46100 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRXP46100 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRXP46100 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRXP46100 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRXP46100 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRXP46100 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRXP46100 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRXP46100 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRXP46100 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRXP46100 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRXP46100 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRXP46100 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRXP46100 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRXP46100 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRXP46100 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRXP46100 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRXP46100 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRXP46100 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRXP46100 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRXP46100 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRXP46100 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRXP46100 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRXP46100 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRXP46100 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRXP46100 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRXP46100 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRXP46100 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRXP46100 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRXP46100 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRXP46100 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRXP46100 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRXP46100 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRXP46100 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRXP46100 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRXP46100 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRXP46100 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRXP46100 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRXP46100 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRXP46100 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRXP46100 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATRXP46100 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRXP46100 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRXP46100 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRXP46100 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRXP46100 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRXP46100 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRXP46100 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATRXP46100 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRXP46100 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRXP46100 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATRXP46100 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRXP46100 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRXP46100 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATRXP46100 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRXP46100 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRXP46100 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRXP46100 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRXP46100 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRXP46100 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATRXP46100 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRXP46100 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRXP46100 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRXP46100 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRXP46100 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRXP46100 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRXP46100 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATRXP46100 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms