Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MAGEA3P43357 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAGEA3P43357 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MAGEA3P43357 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAGEA3P43357 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms