Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSR1P43307 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSR1P43307 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSR1P43307 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSR1P43307 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSR1P43307 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSR1P43307 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSR1P43307 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSR1P43307 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSR1P43307 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSR1P43307 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSR1P43307 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSR1P43307 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSR1P43307 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSR1P43307 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSR1P43307 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSR1P43307 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SSR1P43307 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSR1P43307 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSR1P43307 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSR1P43307 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSR1P43307 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSR1P43307 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SSR1P43307 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SSR1P43307 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSR1P43307 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SSR1P43307 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSR1P43307 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSR1P43307 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSR1P43307 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSR1P43307 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSR1P43307 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSR1P43307 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSR1P43307 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSR1P43307 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSR1P43307 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSR1P43307 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSR1P43307 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSR1P43307 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SSR1P43307 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSR1P43307 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSR1P43307 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSR1P43307 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSR1P43307 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSR1P43307 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSR1P43307 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSR1P43307 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSR1P43307 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSR1P43307 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSR1P43307 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSR1P43307 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSR1P43307 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSR1P43307 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SSR1P43307 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSR1P43307 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSR1P43307 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSR1P43307 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSR1P43307 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSR1P43307 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSR1P43307 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSR1P43307 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSR1P43307 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSR1P43307 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSR1P43307 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSR1P43307 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSR1P43307 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSR1P43307 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSR1P43307 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSR1P43307 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSR1P43307 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSR1P43307 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSR1P43307 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SSR1P43307 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSR1P43307 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSR1P43307 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SSR1P43307 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSR1P43307 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSR1P43307 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSR1P43307 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSR1P43307 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSR1P43307 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms