Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC1A3P43003 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC1A3P43003 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC1A3P43003 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms