Protein–RNA interactions for Protein: P42702

LIFR, Leukemia inhibitory factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIFRP42702 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIFRP42702 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIFRP42702 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIFRP42702 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LIFRP42702 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIFRP42702 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIFRP42702 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIFRP42702 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIFRP42702 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIFRP42702 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LIFRP42702 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LIFRP42702 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIFRP42702 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIFRP42702 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIFRP42702 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LIFRP42702 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIFRP42702 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIFRP42702 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIFRP42702 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LIFRP42702 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LIFRP42702 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LIFRP42702 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LIFRP42702 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIFRP42702 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIFRP42702 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIFRP42702 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LIFRP42702 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LIFRP42702 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIFRP42702 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIFRP42702 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIFRP42702 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIFRP42702 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LIFRP42702 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LIFRP42702 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIFRP42702 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIFRP42702 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIFRP42702 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIFRP42702 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LIFRP42702 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LIFRP42702 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LIFRP42702 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LIFRP42702 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LIFRP42702 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIFRP42702 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIFRP42702 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIFRP42702 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIFRP42702 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIFRP42702 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LIFRP42702 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LIFRP42702 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LIFRP42702 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LIFRP42702 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LIFRP42702 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LIFRP42702 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LIFRP42702 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIFRP42702 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LIFRP42702 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIFRP42702 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIFRP42702 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIFRP42702 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIFRP42702 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LIFRP42702 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIFRP42702 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIFRP42702 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIFRP42702 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LIFRP42702 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIFRP42702 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LIFRP42702 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIFRP42702 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LIFRP42702 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LIFRP42702 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LIFRP42702 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIFRP42702 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIFRP42702 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LIFRP42702 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIFRP42702 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIFRP42702 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LIFRP42702 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIFRP42702 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIFRP42702 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIFRP42702 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LIFRP42702 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIFRP42702 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIFRP42702 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIFRP42702 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIFRP42702 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIFRP42702 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIFRP42702 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LIFRP42702 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIFRP42702 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIFRP42702 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIFRP42702 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIFRP42702 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIFRP42702 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIFRP42702 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIFRP42702 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LIFRP42702 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LIFRP42702 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LIFRP42702 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LIFRP42702 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms