Protein–RNA interactions for Protein: P42345

MTOR, Serine/threonine-protein kinase mTOR, humanhuman

Predictions only

Length 2,549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTORP42345 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MTORP42345 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MTORP42345 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTORP42345 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTORP42345 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTORP42345 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTORP42345 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTORP42345 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTORP42345 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MTORP42345 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTORP42345 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTORP42345 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTORP42345 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTORP42345 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTORP42345 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTORP42345 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTORP42345 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTORP42345 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTORP42345 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTORP42345 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTORP42345 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTORP42345 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTORP42345 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTORP42345 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTORP42345 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTORP42345 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTORP42345 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTORP42345 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTORP42345 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTORP42345 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTORP42345 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTORP42345 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTORP42345 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTORP42345 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTORP42345 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTORP42345 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTORP42345 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MTORP42345 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTORP42345 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MTORP42345 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTORP42345 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTORP42345 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTORP42345 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTORP42345 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTORP42345 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MTORP42345 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTORP42345 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTORP42345 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTORP42345 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTORP42345 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTORP42345 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MTORP42345 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTORP42345 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTORP42345 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTORP42345 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTORP42345 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTORP42345 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTORP42345 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTORP42345 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTORP42345 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTORP42345 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTORP42345 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTORP42345 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTORP42345 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTORP42345 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTORP42345 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTORP42345 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTORP42345 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTORP42345 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTORP42345 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTORP42345 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTORP42345 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTORP42345 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTORP42345 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTORP42345 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTORP42345 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MTORP42345 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTORP42345 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTORP42345 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTORP42345 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTORP42345 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTORP42345 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTORP42345 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTORP42345 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MTORP42345 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTORP42345 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTORP42345 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTORP42345 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTORP42345 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MTORP42345 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms