Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMPOP42166 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMPOP42166 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMPOP42166 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMPOP42166 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMPOP42166 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMPOP42166 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMPOP42166 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TMPOP42166 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMPOP42166 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMPOP42166 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMPOP42166 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMPOP42166 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
TMPOP42166 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TMPOP42166 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TMPOP42166 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TMPOP42166 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TMPOP42166 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
TMPOP42166 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TMPOP42166 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TMPOP42166 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TMPOP42166 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TMPOP42166 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TMPOP42166 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMPOP42166 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMPOP42166 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMPOP42166 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMPOP42166 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TMPOP42166 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMPOP42166 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
TMPOP42166 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMPOP42166 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMPOP42166 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMPOP42166 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TMPOP42166 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TMPOP42166 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMPOP42166 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMPOP42166 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TMPOP42166 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMPOP42166 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMPOP42166 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TMPOP42166 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
TMPOP42166 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMPOP42166 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMPOP42166 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMPOP42166 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMPOP42166 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMPOP42166 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMPOP42166 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMPOP42166 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TMPOP42166 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TMPOP42166 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TMPOP42166 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TMPOP42166 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMPOP42166 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMPOP42166 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
TMPOP42166 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMPOP42166 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMPOP42166 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TMPOP42166 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TMPOP42166 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TMPOP42166 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TMPOP42166 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TMPOP42166 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMPOP42166 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMPOP42166 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
TMPOP42166 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMPOP42166 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMPOP42166 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMPOP42166 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMPOP42166 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMPOP42166 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMPOP42166 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMPOP42166 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMPOP42166 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMPOP42166 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMPOP42166 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TMPOP42166 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMPOP42166 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMPOP42166 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TMPOP42166 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMPOP42166 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMPOP42166 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMPOP42166 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMPOP42166 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMPOP42166 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMPOP42166 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMPOP42166 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMPOP42166 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMPOP42166 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMPOP42166 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMPOP42166 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
TMPOP42166 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMPOP42166 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMPOP42166 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMPOP42166 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMPOP42166 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMPOP42166 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMPOP42166 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMPOP42166 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms