Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP8P40818 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP8P40818 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP8P40818 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP8P40818 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP8P40818 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP8P40818 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP8P40818 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP8P40818 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP8P40818 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP8P40818 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP8P40818 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP8P40818 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP8P40818 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP8P40818 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP8P40818 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP8P40818 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP8P40818 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP8P40818 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP8P40818 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP8P40818 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP8P40818 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP8P40818 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP8P40818 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP8P40818 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP8P40818 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP8P40818 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP8P40818 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP8P40818 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP8P40818 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP8P40818 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP8P40818 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP8P40818 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP8P40818 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP8P40818 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP8P40818 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP8P40818 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP8P40818 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP8P40818 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP8P40818 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP8P40818 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP8P40818 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP8P40818 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP8P40818 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP8P40818 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP8P40818 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP8P40818 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP8P40818 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP8P40818 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP8P40818 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP8P40818 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP8P40818 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP8P40818 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP8P40818 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP8P40818 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP8P40818 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP8P40818 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP8P40818 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP8P40818 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP8P40818 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP8P40818 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP8P40818 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP8P40818 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP8P40818 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP8P40818 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP8P40818 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP8P40818 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP8P40818 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP8P40818 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP8P40818 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP8P40818 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP8P40818 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP8P40818 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP8P40818 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP8P40818 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP8P40818 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP8P40818 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP8P40818 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms