Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FEN1P39748 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FEN1P39748 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FEN1P39748 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FEN1P39748 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FEN1P39748 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FEN1P39748 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FEN1P39748 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FEN1P39748 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FEN1P39748 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FEN1P39748 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FEN1P39748 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FEN1P39748 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FEN1P39748 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FEN1P39748 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FEN1P39748 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FEN1P39748 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FEN1P39748 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FEN1P39748 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FEN1P39748 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FEN1P39748 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FEN1P39748 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FEN1P39748 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FEN1P39748 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FEN1P39748 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FEN1P39748 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FEN1P39748 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FEN1P39748 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FEN1P39748 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FEN1P39748 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FEN1P39748 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FEN1P39748 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FEN1P39748 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FEN1P39748 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FEN1P39748 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FEN1P39748 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FEN1P39748 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FEN1P39748 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FEN1P39748 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FEN1P39748 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FEN1P39748 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FEN1P39748 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FEN1P39748 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FEN1P39748 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FEN1P39748 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FEN1P39748 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FEN1P39748 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FEN1P39748 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FEN1P39748 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FEN1P39748 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FEN1P39748 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FEN1P39748 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FEN1P39748 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FEN1P39748 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FEN1P39748 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FEN1P39748 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FEN1P39748 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FEN1P39748 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FEN1P39748 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FEN1P39748 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FEN1P39748 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FEN1P39748 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FEN1P39748 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FEN1P39748 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FEN1P39748 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FEN1P39748 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FEN1P39748 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FEN1P39748 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FEN1P39748 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FEN1P39748 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FEN1P39748 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FEN1P39748 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FEN1P39748 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FEN1P39748 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FEN1P39748 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FEN1P39748 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FEN1P39748 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FEN1P39748 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FEN1P39748 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FEN1P39748 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FEN1P39748 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FEN1P39748 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FEN1P39748 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FEN1P39748 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FEN1P39748 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FEN1P39748 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FEN1P39748 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FEN1P39748 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FEN1P39748 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FEN1P39748 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms