Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGM1P36871 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGM1P36871 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGM1P36871 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGM1P36871 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGM1P36871 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGM1P36871 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGM1P36871 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGM1P36871 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGM1P36871 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGM1P36871 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGM1P36871 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGM1P36871 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGM1P36871 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGM1P36871 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGM1P36871 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGM1P36871 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGM1P36871 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGM1P36871 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGM1P36871 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGM1P36871 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGM1P36871 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGM1P36871 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGM1P36871 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGM1P36871 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGM1P36871 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGM1P36871 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGM1P36871 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGM1P36871 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGM1P36871 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGM1P36871 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGM1P36871 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGM1P36871 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGM1P36871 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGM1P36871 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGM1P36871 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGM1P36871 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGM1P36871 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGM1P36871 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGM1P36871 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGM1P36871 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGM1P36871 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGM1P36871 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGM1P36871 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGM1P36871 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGM1P36871 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGM1P36871 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGM1P36871 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGM1P36871 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGM1P36871 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGM1P36871 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGM1P36871 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGM1P36871 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGM1P36871 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGM1P36871 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGM1P36871 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGM1P36871 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGM1P36871 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGM1P36871 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGM1P36871 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGM1P36871 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGM1P36871 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGM1P36871 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGM1P36871 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGM1P36871 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM1P36871 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM1P36871 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM1P36871 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM1P36871 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGM1P36871 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM1P36871 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM1P36871 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM1P36871 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM1P36871 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM1P36871 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGM1P36871 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM1P36871 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM1P36871 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM1P36871 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGM1P36871 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM1P36871 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM1P36871 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM1P36871 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGM1P36871 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGM1P36871 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGM1P36871 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PGM1P36871 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PGM1P36871 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGM1P36871 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGM1P36871 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms