Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHI3L1P36222 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHI3L1P36222 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHI3L1P36222 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHI3L1P36222 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms