Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYLC1P35663 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYLC1P35663 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYLC1P35663 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms