Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SFTPDP35247 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SFTPDP35247 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SFTPDP35247 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms