Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HSPA4P34932 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HSPA4P34932 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HSPA4P34932 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HSPA4P34932 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms