Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDELR2P33947 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KDELR2P33947 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDELR2P33947 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms