Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC1P29353 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC1P29353 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC1P29353 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC1P29353 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC1P29353 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHC1P29353 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SHC1P29353 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC1P29353 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC1P29353 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC1P29353 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC1P29353 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC1P29353 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC1P29353 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHC1P29353 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC1P29353 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC1P29353 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC1P29353 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC1P29353 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC1P29353 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC1P29353 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHC1P29353 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHC1P29353 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHC1P29353 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHC1P29353 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHC1P29353 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHC1P29353 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHC1P29353 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHC1P29353 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SHC1P29353 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHC1P29353 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHC1P29353 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHC1P29353 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHC1P29353 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHC1P29353 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHC1P29353 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHC1P29353 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHC1P29353 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHC1P29353 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHC1P29353 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHC1P29353 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHC1P29353 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHC1P29353 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHC1P29353 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHC1P29353 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SHC1P29353 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHC1P29353 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHC1P29353 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SHC1P29353 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHC1P29353 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SHC1P29353 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SHC1P29353 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SHC1P29353 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHC1P29353 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHC1P29353 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHC1P29353 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHC1P29353 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHC1P29353 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHC1P29353 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SHC1P29353 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHC1P29353 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHC1P29353 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHC1P29353 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHC1P29353 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHC1P29353 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHC1P29353 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHC1P29353 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHC1P29353 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHC1P29353 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHC1P29353 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHC1P29353 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHC1P29353 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHC1P29353 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SHC1P29353 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHC1P29353 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SHC1P29353 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SHC1P29353 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHC1P29353 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHC1P29353 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHC1P29353 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHC1P29353 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHC1P29353 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHC1P29353 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHC1P29353 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHC1P29353 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHC1P29353 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHC1P29353 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHC1P29353 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHC1P29353 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHC1P29353 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHC1P29353 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHC1P29353 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHC1P29353 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHC1P29353 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHC1P29353 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHC1P29353 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SHC1P29353 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHC1P29353 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHC1P29353 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SHC1P29353 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms