Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GABRB3P28472 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABRB3P28472 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABRB3P28472 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABRB3P28472 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms