Protein–RNA interactions for Protein: P27540

ARNT, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTP27540 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTP27540 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTP27540 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTP27540 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTP27540 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTP27540 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTP27540 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTP27540 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTP27540 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTP27540 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTP27540 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTP27540 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTP27540 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTP27540 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTP27540 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTP27540 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTP27540 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTP27540 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTP27540 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTP27540 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTP27540 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTP27540 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARNTP27540 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARNTP27540 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARNTP27540 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARNTP27540 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARNTP27540 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARNTP27540 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARNTP27540 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARNTP27540 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARNTP27540 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARNTP27540 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARNTP27540 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARNTP27540 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARNTP27540 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARNTP27540 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARNTP27540 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARNTP27540 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARNTP27540 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARNTP27540 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARNTP27540 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARNTP27540 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARNTP27540 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARNTP27540 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARNTP27540 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARNTP27540 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARNTP27540 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARNTP27540 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARNTP27540 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARNTP27540 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ARNTP27540 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARNTP27540 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARNTP27540 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARNTP27540 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARNTP27540 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARNTP27540 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARNTP27540 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARNTP27540 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARNTP27540 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARNTP27540 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARNTP27540 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARNTP27540 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARNTP27540 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARNTP27540 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARNTP27540 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARNTP27540 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARNTP27540 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARNTP27540 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARNTP27540 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARNTP27540 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARNTP27540 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARNTP27540 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARNTP27540 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARNTP27540 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARNTP27540 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARNTP27540 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARNTP27540 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARNTP27540 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARNTP27540 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARNTP27540 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARNTP27540 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARNTP27540 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARNTP27540 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARNTP27540 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARNTP27540 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARNTP27540 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARNTP27540 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARNTP27540 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARNTP27540 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARNTP27540 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARNTP27540 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARNTP27540 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARNTP27540 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARNTP27540 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARNTP27540 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARNTP27540 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARNTP27540 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARNTP27540 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARNTP27540 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARNTP27540 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms