Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA3P26006 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITGA3P26006 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms