Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSSP25774 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSSP25774 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSSP25774 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSSP25774 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSSP25774 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTSSP25774 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSSP25774 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSSP25774 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSSP25774 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSSP25774 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSSP25774 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSSP25774 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTSSP25774 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSSP25774 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSSP25774 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSSP25774 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSSP25774 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSSP25774 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSSP25774 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTSSP25774 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CTSSP25774 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSSP25774 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSSP25774 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSSP25774 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSSP25774 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTSSP25774 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSSP25774 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSSP25774 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSSP25774 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSSP25774 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSSP25774 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSSP25774 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSSP25774 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSSP25774 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTSSP25774 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSSP25774 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSSP25774 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSSP25774 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTSSP25774 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSSP25774 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSSP25774 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSSP25774 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTSSP25774 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSSP25774 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSSP25774 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSSP25774 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSSP25774 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTSSP25774 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTSSP25774 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTSSP25774 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTSSP25774 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTSSP25774 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTSSP25774 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTSSP25774 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTSSP25774 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTSSP25774 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSSP25774 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSSP25774 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSSP25774 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSSP25774 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSSP25774 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTSSP25774 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSSP25774 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSSP25774 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSSP25774 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSSP25774 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSSP25774 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSSP25774 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSSP25774 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTSSP25774 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSSP25774 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSSP25774 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSSP25774 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSSP25774 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTSSP25774 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSSP25774 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSSP25774 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTSSP25774 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSSP25774 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSSP25774 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSSP25774 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSSP25774 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSSP25774 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSSP25774 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSSP25774 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSSP25774 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSSP25774 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSSP25774 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSSP25774 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSSP25774 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSSP25774 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSSP25774 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSSP25774 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSSP25774 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSSP25774 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSSP25774 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSSP25774 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSSP25774 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSSP25774 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms