Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TACR1P25103 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TACR1P25103 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TACR1P25103 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TACR1P25103 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TACR1P25103 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TACR1P25103 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TACR1P25103 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TACR1P25103 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TACR1P25103 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TACR1P25103 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TACR1P25103 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TACR1P25103 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TACR1P25103 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TACR1P25103 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TACR1P25103 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TACR1P25103 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TACR1P25103 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TACR1P25103 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TACR1P25103 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TACR1P25103 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TACR1P25103 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TACR1P25103 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TACR1P25103 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TACR1P25103 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TACR1P25103 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TACR1P25103 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TACR1P25103 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TACR1P25103 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TACR1P25103 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TACR1P25103 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TACR1P25103 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TACR1P25103 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TACR1P25103 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TACR1P25103 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TACR1P25103 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TACR1P25103 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TACR1P25103 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TACR1P25103 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TACR1P25103 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TACR1P25103 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TACR1P25103 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TACR1P25103 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TACR1P25103 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TACR1P25103 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TACR1P25103 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TACR1P25103 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TACR1P25103 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TACR1P25103 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TACR1P25103 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TACR1P25103 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TACR1P25103 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TACR1P25103 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TACR1P25103 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TACR1P25103 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TACR1P25103 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TACR1P25103 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TACR1P25103 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TACR1P25103 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TACR1P25103 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TACR1P25103 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TACR1P25103 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TACR1P25103 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TACR1P25103 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TACR1P25103 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TACR1P25103 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TACR1P25103 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TACR1P25103 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TACR1P25103 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TACR1P25103 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TACR1P25103 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TACR1P25103 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TACR1P25103 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TACR1P25103 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TACR1P25103 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TACR1P25103 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TACR1P25103 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TACR1P25103 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TACR1P25103 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TACR1P25103 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TACR1P25103 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TACR1P25103 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.5 ms