Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6KB1P23443 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6KB1P23443 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPS6KB1P23443 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms