Protein–RNA interactions for Protein: P23415

GLRA1, Glycine receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLRA1P23415 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GLRA1P23415 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GLRA1P23415 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GLRA1P23415 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms