Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP6V1B2P21281 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP6V1B2P21281 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6V1B2P21281 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms