Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RASA1P20936 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RASA1P20936 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RASA1P20936 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RASA1P20936 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RASA1P20936 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RASA1P20936 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RASA1P20936 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RASA1P20936 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RASA1P20936 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RASA1P20936 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RASA1P20936 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RASA1P20936 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASA1P20936 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASA1P20936 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASA1P20936 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASA1P20936 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASA1P20936 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASA1P20936 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASA1P20936 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASA1P20936 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASA1P20936 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASA1P20936 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASA1P20936 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RASA1P20936 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASA1P20936 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RASA1P20936 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RASA1P20936 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASA1P20936 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASA1P20936 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RASA1P20936 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RASA1P20936 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RASA1P20936 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RASA1P20936 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RASA1P20936 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RASA1P20936 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASA1P20936 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASA1P20936 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RASA1P20936 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASA1P20936 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASA1P20936 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASA1P20936 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASA1P20936 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RASA1P20936 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASA1P20936 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RASA1P20936 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RASA1P20936 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RASA1P20936 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RASA1P20936 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASA1P20936 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASA1P20936 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASA1P20936 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASA1P20936 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASA1P20936 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASA1P20936 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RASA1P20936 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASA1P20936 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASA1P20936 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASA1P20936 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASA1P20936 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASA1P20936 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASA1P20936 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASA1P20936 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASA1P20936 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RASA1P20936 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RASA1P20936 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASA1P20936 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASA1P20936 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASA1P20936 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASA1P20936 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASA1P20936 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASA1P20936 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASA1P20936 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RASA1P20936 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RASA1P20936 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RASA1P20936 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RASA1P20936 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RASA1P20936 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RASA1P20936 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASA1P20936 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASA1P20936 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RASA1P20936 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASA1P20936 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RASA1P20936 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RASA1P20936 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RASA1P20936 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RASA1P20936 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RASA1P20936 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RASA1P20936 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASA1P20936 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASA1P20936 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASA1P20936 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASA1P20936 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA1P20936 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA1P20936 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA1P20936 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA1P20936 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA1P20936 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA1P20936 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASA1P20936 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms