Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB5AP20339 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB5AP20339 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms