Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DPA1P20036 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DPA1P20036 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DPA1P20036 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms