Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFE3P19532 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TFE3P19532 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFE3P19532 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFE3P19532 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFE3P19532 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TFE3P19532 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFE3P19532 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFE3P19532 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFE3P19532 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TFE3P19532 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFE3P19532 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFE3P19532 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFE3P19532 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFE3P19532 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TFE3P19532 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFE3P19532 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFE3P19532 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFE3P19532 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TFE3P19532 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TFE3P19532 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFE3P19532 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFE3P19532 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFE3P19532 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFE3P19532 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFE3P19532 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFE3P19532 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TFE3P19532 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFE3P19532 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFE3P19532 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TFE3P19532 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFE3P19532 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFE3P19532 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFE3P19532 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TFE3P19532 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFE3P19532 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFE3P19532 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TFE3P19532 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFE3P19532 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFE3P19532 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFE3P19532 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TFE3P19532 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFE3P19532 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFE3P19532 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFE3P19532 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TFE3P19532 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TFE3P19532 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFE3P19532 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TFE3P19532 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFE3P19532 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFE3P19532 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFE3P19532 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TFE3P19532 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TFE3P19532 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFE3P19532 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFE3P19532 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFE3P19532 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TFE3P19532 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TFE3P19532 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFE3P19532 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFE3P19532 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFE3P19532 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFE3P19532 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFE3P19532 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFE3P19532 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFE3P19532 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFE3P19532 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TFE3P19532 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFE3P19532 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFE3P19532 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFE3P19532 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TFE3P19532 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFE3P19532 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TFE3P19532 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TFE3P19532 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFE3P19532 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFE3P19532 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TFE3P19532 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TFE3P19532 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFE3P19532 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFE3P19532 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFE3P19532 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFE3P19532 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFE3P19532 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFE3P19532 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TFE3P19532 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFE3P19532 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFE3P19532 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFE3P19532 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TFE3P19532 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFE3P19532 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFE3P19532 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TFE3P19532 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFE3P19532 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFE3P19532 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFE3P19532 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFE3P19532 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFE3P19532 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TFE3P19532 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TFE3P19532 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms