Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCLP19338 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCLP19338 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCLP19338 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCLP19338 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCLP19338 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NCLP19338 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCLP19338 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCLP19338 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCLP19338 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCLP19338 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCLP19338 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCLP19338 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCLP19338 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCLP19338 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NCLP19338 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCLP19338 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCLP19338 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCLP19338 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCLP19338 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NCLP19338 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCLP19338 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCLP19338 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NCLP19338 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NCLP19338 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCLP19338 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCLP19338 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NCLP19338 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCLP19338 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCLP19338 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCLP19338 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NCLP19338 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCLP19338 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCLP19338 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCLP19338 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCLP19338 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCLP19338 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCLP19338 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCLP19338 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NCLP19338 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCLP19338 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCLP19338 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCLP19338 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCLP19338 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCLP19338 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCLP19338 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCLP19338 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCLP19338 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NCLP19338 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCLP19338 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCLP19338 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCLP19338 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCLP19338 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCLP19338 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NCLP19338 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCLP19338 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCLP19338 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCLP19338 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCLP19338 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NCLP19338 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NCLP19338 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCLP19338 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCLP19338 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCLP19338 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NCLP19338 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCLP19338 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCLP19338 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCLP19338 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCLP19338 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCLP19338 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCLP19338 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCLP19338 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCLP19338 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCLP19338 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCLP19338 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCLP19338 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCLP19338 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCLP19338 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCLP19338 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCLP19338 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCLP19338 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCLP19338 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCLP19338 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCLP19338 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCLP19338 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCLP19338 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCLP19338 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCLP19338 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCLP19338 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCLP19338 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCLP19338 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCLP19338 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCLP19338 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCLP19338 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCLP19338 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCLP19338 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCLP19338 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCLP19338 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCLP19338 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCLP19338 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms