Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTPS1P17812 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTPS1P17812 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms