Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYN1P17600 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYN1P17600 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYN1P17600 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYN1P17600 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SYN1P17600 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYN1P17600 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYN1P17600 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SYN1P17600 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYN1P17600 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SYN1P17600 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYN1P17600 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYN1P17600 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYN1P17600 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYN1P17600 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYN1P17600 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SYN1P17600 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYN1P17600 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYN1P17600 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYN1P17600 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYN1P17600 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SYN1P17600 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYN1P17600 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYN1P17600 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYN1P17600 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYN1P17600 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYN1P17600 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYN1P17600 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYN1P17600 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYN1P17600 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYN1P17600 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYN1P17600 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYN1P17600 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SYN1P17600 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYN1P17600 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYN1P17600 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYN1P17600 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYN1P17600 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYN1P17600 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYN1P17600 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYN1P17600 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYN1P17600 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYN1P17600 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SYN1P17600 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYN1P17600 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYN1P17600 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYN1P17600 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYN1P17600 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYN1P17600 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SYN1P17600 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYN1P17600 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYN1P17600 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYN1P17600 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYN1P17600 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYN1P17600 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYN1P17600 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYN1P17600 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYN1P17600 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYN1P17600 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYN1P17600 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SYN1P17600 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYN1P17600 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYN1P17600 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYN1P17600 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYN1P17600 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SYN1P17600 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYN1P17600 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SYN1P17600 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYN1P17600 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYN1P17600 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYN1P17600 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYN1P17600 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYN1P17600 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYN1P17600 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYN1P17600 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYN1P17600 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SYN1P17600 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYN1P17600 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYN1P17600 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYN1P17600 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYN1P17600 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYN1P17600 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYN1P17600 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYN1P17600 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYN1P17600 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYN1P17600 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYN1P17600 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYN1P17600 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYN1P17600 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYN1P17600 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms