Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMPD1P17405 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMPD1P17405 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMPD1P17405 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms