Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MUC1P15941 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MUC1P15941 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MUC1P15941 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MUC1P15941 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MUC1P15941 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MUC1P15941 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MUC1P15941 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MUC1P15941 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MUC1P15941 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MUC1P15941 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MUC1P15941 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MUC1P15941 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MUC1P15941 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MUC1P15941 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MUC1P15941 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MUC1P15941 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MUC1P15941 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MUC1P15941 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MUC1P15941 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MUC1P15941 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MUC1P15941 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MUC1P15941 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MUC1P15941 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MUC1P15941 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MUC1P15941 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MUC1P15941 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MUC1P15941 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MUC1P15941 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MUC1P15941 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MUC1P15941 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MUC1P15941 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MUC1P15941 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MUC1P15941 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MUC1P15941 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MUC1P15941 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MUC1P15941 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MUC1P15941 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MUC1P15941 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MUC1P15941 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MUC1P15941 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MUC1P15941 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MUC1P15941 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MUC1P15941 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MUC1P15941 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MUC1P15941 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MUC1P15941 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MUC1P15941 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MUC1P15941 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MUC1P15941 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MUC1P15941 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MUC1P15941 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MUC1P15941 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MUC1P15941 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MUC1P15941 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MUC1P15941 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MUC1P15941 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MUC1P15941 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MUC1P15941 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MUC1P15941 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MUC1P15941 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MUC1P15941 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MUC1P15941 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MUC1P15941 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MUC1P15941 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MUC1P15941 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MUC1P15941 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MUC1P15941 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MUC1P15941 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MUC1P15941 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MUC1P15941 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MUC1P15941 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MUC1P15941 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MUC1P15941 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MUC1P15941 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MUC1P15941 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MUC1P15941 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MUC1P15941 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MUC1P15941 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MUC1P15941 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MUC1P15941 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MUC1P15941 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MUC1P15941 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MUC1P15941 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MUC1P15941 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MUC1P15941 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MUC1P15941 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MUC1P15941 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MUC1P15941 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MUC1P15941 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms