Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NID1P14543 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NID1P14543 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NID1P14543 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NID1P14543 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NID1P14543 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NID1P14543 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NID1P14543 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NID1P14543 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NID1P14543 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NID1P14543 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NID1P14543 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NID1P14543 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NID1P14543 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NID1P14543 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NID1P14543 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NID1P14543 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NID1P14543 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NID1P14543 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NID1P14543 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NID1P14543 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NID1P14543 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NID1P14543 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NID1P14543 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NID1P14543 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NID1P14543 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NID1P14543 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NID1P14543 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NID1P14543 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NID1P14543 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NID1P14543 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NID1P14543 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NID1P14543 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NID1P14543 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NID1P14543 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NID1P14543 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NID1P14543 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NID1P14543 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NID1P14543 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NID1P14543 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NID1P14543 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NID1P14543 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NID1P14543 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NID1P14543 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NID1P14543 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NID1P14543 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NID1P14543 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NID1P14543 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NID1P14543 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NID1P14543 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NID1P14543 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NID1P14543 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NID1P14543 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NID1P14543 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NID1P14543 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NID1P14543 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NID1P14543 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NID1P14543 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NID1P14543 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NID1P14543 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NID1P14543 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NID1P14543 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NID1P14543 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NID1P14543 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NID1P14543 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NID1P14543 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NID1P14543 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NID1P14543 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NID1P14543 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NID1P14543 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NID1P14543 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NID1P14543 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NID1P14543 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NID1P14543 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NID1P14543 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NID1P14543 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NID1P14543 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NID1P14543 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NID1P14543 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NID1P14543 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NID1P14543 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NID1P14543 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NID1P14543 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NID1P14543 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NID1P14543 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NID1P14543 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NID1P14543 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NID1P14543 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NID1P14543 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NID1P14543 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NID1P14543 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NID1P14543 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NID1P14543 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NID1P14543 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NID1P14543 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NID1P14543 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NID1P14543 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NID1P14543 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NID1P14543 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NID1P14543 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms