Protein–RNA interactions for Protein: P13671

C6, Complement component C6, humanhuman

Predictions only

Length 934 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6P13671 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6P13671 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6P13671 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6P13671 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6P13671 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6P13671 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6P13671 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6P13671 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6P13671 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6P13671 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6P13671 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6P13671 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6P13671 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6P13671 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6P13671 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C6P13671 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6P13671 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6P13671 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6P13671 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6P13671 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C6P13671 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6P13671 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6P13671 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6P13671 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6P13671 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C6P13671 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6P13671 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6P13671 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6P13671 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C6P13671 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C6P13671 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C6P13671 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C6P13671 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C6P13671 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C6P13671 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C6P13671 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C6P13671 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C6P13671 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C6P13671 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C6P13671 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C6P13671 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C6P13671 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C6P13671 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C6P13671 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C6P13671 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C6P13671 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C6P13671 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C6P13671 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C6P13671 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C6P13671 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C6P13671 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C6P13671 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C6P13671 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C6P13671 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6P13671 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6P13671 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6P13671 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6P13671 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6P13671 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6P13671 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6P13671 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C6P13671 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6P13671 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6P13671 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C6P13671 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6P13671 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6P13671 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C6P13671 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6P13671 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C6P13671 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C6P13671 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6P13671 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C6P13671 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6P13671 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6P13671 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6P13671 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6P13671 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6P13671 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6P13671 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6P13671 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C6P13671 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6P13671 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6P13671 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6P13671 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6P13671 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C6P13671 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6P13671 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C6P13671 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C6P13671 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C6P13671 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms