Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDGF1P13385 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TDGF1P13385 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDGF1P13385 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDGF1P13385 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms