Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COX4I1P13073 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I1P13073 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COX4I1P13073 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX4I1P13073 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms