Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
RLBP1P12271 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RLBP1P12271 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RLBP1P12271 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
RLBP1P12271 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms