Protein–RNA interactions for Protein: P10644

PRKAR1A, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1AP10644 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAR1AP10644 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAR1AP10644 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms