Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMIGD3P0DMS9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMIGD3P0DMS9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMIGD3P0DMS9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms