Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP17L7P0C7H9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP17L7P0C7H9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L7P0C7H9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms