Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
HOXB7P09629 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
HOXB7P09629 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
HOXB7P09629 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HOXB7P09629 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
HOXB7P09629 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms