Protein–RNA interactions for Protein: P09486

SPARC, SPARC, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCP09486 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCP09486 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCP09486 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPARCP09486 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCP09486 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCP09486 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCP09486 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCP09486 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCP09486 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCP09486 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPARCP09486 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCP09486 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCP09486 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCP09486 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCP09486 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCP09486 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPARCP09486 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCP09486 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCP09486 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCP09486 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCP09486 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCP09486 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPARCP09486 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPARCP09486 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCP09486 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCP09486 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPARCP09486 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCP09486 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCP09486 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCP09486 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCP09486 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPARCP09486 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCP09486 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCP09486 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCP09486 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCP09486 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCP09486 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCP09486 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPARCP09486 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPARCP09486 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCP09486 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCP09486 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCP09486 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCP09486 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCP09486 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCP09486 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCP09486 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCP09486 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPARCP09486 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SPARCP09486 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPARCP09486 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPARCP09486 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPARCP09486 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPARCP09486 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPARCP09486 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPARCP09486 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPARCP09486 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPARCP09486 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPARCP09486 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPARCP09486 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPARCP09486 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPARCP09486 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPARCP09486 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPARCP09486 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPARCP09486 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPARCP09486 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPARCP09486 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPARCP09486 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPARCP09486 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SPARCP09486 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPARCP09486 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPARCP09486 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPARCP09486 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPARCP09486 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPARCP09486 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPARCP09486 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPARCP09486 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPARCP09486 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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