Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOP08100 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOP08100 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOP08100 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOP08100 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOP08100 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOP08100 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOP08100 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOP08100 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOP08100 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOP08100 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOP08100 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOP08100 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOP08100 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOP08100 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOP08100 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOP08100 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOP08100 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOP08100 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOP08100 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOP08100 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOP08100 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOP08100 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOP08100 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOP08100 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOP08100 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOP08100 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOP08100 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOP08100 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOP08100 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOP08100 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOP08100 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOP08100 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOP08100 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOP08100 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOP08100 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOP08100 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOP08100 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOP08100 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOP08100 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOP08100 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOP08100 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOP08100 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOP08100 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOP08100 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOP08100 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOP08100 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RHOP08100 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOP08100 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOP08100 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOP08100 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOP08100 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOP08100 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOP08100 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOP08100 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOP08100 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOP08100 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOP08100 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOP08100 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOP08100 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOP08100 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOP08100 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOP08100 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOP08100 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOP08100 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOP08100 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOP08100 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOP08100 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOP08100 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOP08100 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOP08100 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOP08100 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOP08100 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOP08100 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOP08100 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOP08100 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOP08100 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOP08100 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOP08100 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms