Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEFLP07196 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEFLP07196 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEFLP07196 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEFLP07196 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEFLP07196 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEFLP07196 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEFLP07196 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEFLP07196 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEFLP07196 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEFLP07196 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NEFLP07196 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NEFLP07196 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEFLP07196 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEFLP07196 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEFLP07196 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEFLP07196 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEFLP07196 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEFLP07196 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEFLP07196 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEFLP07196 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEFLP07196 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEFLP07196 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEFLP07196 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEFLP07196 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEFLP07196 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEFLP07196 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEFLP07196 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEFLP07196 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEFLP07196 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEFLP07196 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NEFLP07196 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEFLP07196 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEFLP07196 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEFLP07196 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEFLP07196 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEFLP07196 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEFLP07196 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEFLP07196 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEFLP07196 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NEFLP07196 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NEFLP07196 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NEFLP07196 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NEFLP07196 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEFLP07196 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEFLP07196 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEFLP07196 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEFLP07196 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEFLP07196 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEFLP07196 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEFLP07196 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEFLP07196 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEFLP07196 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEFLP07196 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEFLP07196 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEFLP07196 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEFLP07196 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
NEFLP07196 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NEFLP07196 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEFLP07196 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEFLP07196 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEFLP07196 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEFLP07196 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEFLP07196 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEFLP07196 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEFLP07196 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NEFLP07196 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NEFLP07196 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NEFLP07196 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
NEFLP07196 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
NEFLP07196 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEFLP07196 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEFLP07196 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEFLP07196 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEFLP07196 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NEFLP07196 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NEFLP07196 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEFLP07196 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEFLP07196 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEFLP07196 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEFLP07196 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEFLP07196 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NEFLP07196 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEFLP07196 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEFLP07196 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEFLP07196 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NEFLP07196 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEFLP07196 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEFLP07196 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEFLP07196 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEFLP07196 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEFLP07196 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEFLP07196 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NEFLP07196 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEFLP07196 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEFLP07196 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
NEFLP07196 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEFLP07196 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEFLP07196 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEFLP07196 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms