Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TFAP2AP05549 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFAP2AP05549 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms