Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYMSP04818 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYMSP04818 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYMSP04818 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TYMSP04818 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYMSP04818 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYMSP04818 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TYMSP04818 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYMSP04818 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TYMSP04818 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TYMSP04818 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYMSP04818 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYMSP04818 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYMSP04818 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TYMSP04818 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TYMSP04818 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYMSP04818 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYMSP04818 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYMSP04818 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TYMSP04818 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TYMSP04818 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TYMSP04818 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYMSP04818 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYMSP04818 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYMSP04818 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYMSP04818 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYMSP04818 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYMSP04818 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYMSP04818 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYMSP04818 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TYMSP04818 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYMSP04818 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYMSP04818 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYMSP04818 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYMSP04818 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TYMSP04818 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYMSP04818 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TYMSP04818 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TYMSP04818 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYMSP04818 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYMSP04818 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYMSP04818 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYMSP04818 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYMSP04818 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYMSP04818 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYMSP04818 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TYMSP04818 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYMSP04818 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYMSP04818 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYMSP04818 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYMSP04818 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYMSP04818 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYMSP04818 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYMSP04818 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYMSP04818 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TYMSP04818 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYMSP04818 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYMSP04818 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYMSP04818 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYMSP04818 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYMSP04818 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYMSP04818 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TYMSP04818 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TYMSP04818 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TYMSP04818 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYMSP04818 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYMSP04818 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYMSP04818 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TYMSP04818 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYMSP04818 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYMSP04818 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYMSP04818 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYMSP04818 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYMSP04818 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYMSP04818 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYMSP04818 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYMSP04818 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TYMSP04818 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms