Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLIC3O95833 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLIC3O95833 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLIC3O95833 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLIC3O95833 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms