Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST3O95803 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST3O95803 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST3O95803 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST3O95803 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST3O95803 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST3O95803 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST3O95803 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST3O95803 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST3O95803 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST3O95803 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST3O95803 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST3O95803 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST3O95803 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST3O95803 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST3O95803 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST3O95803 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDST3O95803 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDST3O95803 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDST3O95803 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST3O95803 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST3O95803 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST3O95803 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST3O95803 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST3O95803 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST3O95803 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST3O95803 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST3O95803 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST3O95803 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST3O95803 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST3O95803 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST3O95803 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST3O95803 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST3O95803 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST3O95803 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST3O95803 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST3O95803 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST3O95803 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST3O95803 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST3O95803 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDST3O95803 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST3O95803 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST3O95803 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST3O95803 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST3O95803 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST3O95803 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST3O95803 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDST3O95803 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST3O95803 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST3O95803 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST3O95803 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDST3O95803 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST3O95803 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST3O95803 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST3O95803 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST3O95803 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDST3O95803 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST3O95803 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST3O95803 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST3O95803 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST3O95803 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST3O95803 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST3O95803 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST3O95803 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST3O95803 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST3O95803 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDST3O95803 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST3O95803 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST3O95803 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST3O95803 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDST3O95803 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST3O95803 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST3O95803 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST3O95803 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST3O95803 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST3O95803 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDST3O95803 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST3O95803 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST3O95803 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST3O95803 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDST3O95803 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST3O95803 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST3O95803 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDST3O95803 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST3O95803 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDST3O95803 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST3O95803 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST3O95803 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST3O95803 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST3O95803 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST3O95803 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST3O95803 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST3O95803 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST3O95803 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDST3O95803 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST3O95803 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST3O95803 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST3O95803 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST3O95803 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NDST3O95803 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms