Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF1O95521 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF1O95521 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF1O95521 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms